Datové sady mutací viru Sars-Cov-2 zjištěných Diskriminačními RT-PCR testy v ČR a to převážně z laboratoří ve VFN.
-
Updated
Apr 16, 2023
Datové sady mutací viru Sars-Cov-2 zjištěných Diskriminačními RT-PCR testy v ČR a to převážně z laboratoří ve VFN.
Rozšíření do prohlížeče obsahující automatický skript vypisující všechny odhalené mutace.
Zobrazuje data pocházející z období 1.9.2021 - 8.2.2022 z VFN a FNB (Delta podzim a Omikron počátek roku). Data obsahují detekované mutace diskriminačními PCR testy, jejich rozložení v čase a srovnání s celogenomově sekvenovanými vzorky ze stejného období co se týče pohlaví.
Shiny app for creating Venn diagrams of SARS-CoV-2 variant/lineage mutations.
Pipeline for analyses of multiple pathogens, like SARS-CoV-2 with positivity rate analyses
A simple program that uses parallel processing to detect deletions in fasta files relative to a reference genome.
Git Repository for Observations of COVID-19 vaccine coverage and vaccine hesitancy on COVID-19 outbreak: An American ecological study
Minor Allele Detection Pipeline for SARS-CoV2
Datové sady mutací viru Sars-Cov-2 zjištěných Diskriminačními RT-PCR testy v ČR a to převážně z laboratoří ve FNB.
Repository to discuss SARS-CoV-2 sequence quality
Easy to view version of RKI SARS-CoV-2 wastewater surveillance reports
Spike-only SARS-CoV-2 Nextstrain build
BA.2.86 project with Sigal lab
Epistatic models predict mutable sites in SARS-CoV-2 proteins and epitopes
VariantHunter is a tool for fast detection of emerging SARS-CoV-2 variants. It's an highly flexible and user friendly application for the systematic monitoring of the evolution of SARS-CoV-2 both at global and regional level.
Download raw data and turn it into useful dataset
SARS-CoV-2 variant growth rates and frequency forecasts
This project tries to give a glimpse of the different variants of SAR-CoV-2 in the world.
bvas: bayesian viral allele selection
Repository to propose and discuss lineages
Add a description, image, and links to the sars-cov-2-variants topic page so that developers can more easily learn about it.
To associate your repository with the sars-cov-2-variants topic, visit your repo's landing page and select "manage topics."