Skip to content

Random Forest implementation for WUT java classes

Notifications You must be signed in to change notification settings

jakwisn/RandomForest

Repository files navigation

Dokumentacja

Autorzy

Paulina Przybyłek Jakub Wiśniewski Dawid Przybyliński

start: 9 grudnia 2019

Konspekt projektu

Cele projektu, jego krótka charakterystyka i opis podziału pracy zostały zawarte w pliku Konspekt.pdf. Projekt będzie realizowany zgodnie z zawartymi tam informacjami. Zaleca się zapoznanie z nim.

Zawartość projektu - opis klas i ich metod

Klasa csvToDataFrame
Celem tej klasy jest konwertowanie plików csv na Ramki danych naszego autorstwa. Do konstruktora przyjmuje ścieżkę do pliku csv oraz separator użyty w pliku. Ważne! Csv MUSI posiadać header, jeżeli nie będzie go miało wczytany zostanie pierwszy wiersz danych. Sprawdzane jest także, czy w żadnej kolumnie podanego pliku csv nie ma pomieszanych wartości numerycznych z wartościami tekstowymi. Jeżeli zajdzie taka sytuacja program wyrzuci wyjątek. Obsługuje wyjątki gdy plik jest pusty oraz gdy nie ma rozszerzenia csv.

getColnames()
zmienia pierwszy wiersz na listę kolumn.

convertToDataFrame()
Konwertuje linia po lini csv i dodaje do obiektu DataFrame.

Klasa DataFrame
Klasa ma za zadanie być naszym głównym narzędziem do posługiwania się danymi. Jednolita, z tymi samymi typami danych w kolumnach będzie świetną i wygodną alternatywą dla R-owych data Frame i Pythonowych Pandasów.

convertToNumeric()
Dla każdej kolumny sprawdza czy jest Stringiem, jeżeli tak, to każdy odmienny string zamienia na inną liczbę. Operacje wykonuje na istniejącym DataFrame. Zwraca void.

setToPredict(String colname)
Oznacza kolumnę jako tą, na której będziemy trenować, a później przewidywać.

getValuesToPredict()
Zwraca nam kolumnę, którą będziemy w przyszłości przewidywać. W szczególności wykorzystywane przy liczeniu indeksu Gini.

getColumn(String column)
Zwraca wartosci w danej kolumnie.

getDataFrame()
Zwraca hashmapę, gdzie klucze to nazwy kolumn, a wartościami są wartości w tych kolumnach.

setColnames(ArrayList colnamesToChange)
Ustawia nowe nazwy kolumn/zmienia nazwy kolumn w DataFrame przy wykorzystaniu metody setColname(String oldName, String newName).

Klasa Gini
Indeks Gini odpowiada dystrybucji klas w zbiorze. Gdy przykładowo w danym zbiorze będzie tyle samo elementów o klasach odpowiednio A oraz B to indeks Gini wynosi 0.5. Jeżeli w tym zbiorze będą tylko elementy klasy B, to indeks wynosił będzie 0. Im mniejszy indeks, tym mniejsza entropia w danym zbiorze. Sam indeks posiada wartości od 0 -gdy jest tylko jedna klasa, do 1, gdy jest nieskończenie wiele klas o bardzo małym prawdopodobieństwie.

Indeks Gini określa się wzorem:

Do konstruktora potrzebuje ramki danych DataFrame z określoną wcześniej kolumną oraz valuesToPredict

calculateGiniIndex(ArrayList <Integer> rowIndexes)
Dla danych indeksów rzędów (a dokładniej dla kolumny toPredict) liczy indeks Gini. Zwraca liczbę zmiennoprzecinkową od 0 do 1.

Klasa Node
Klasa odpowiada za tworzenie węzłów przy budowaniu drzewa. Węzły są decyzyjne (Node.Decision) i jako liście (Node.Leaf), stworzone jako klasy wewnętrzne klasy Node. Leaf zawiera jedynie indeksy jakie wpadają do niego oraz dominantę dla tych indeksów, a Decision: indeksy, nazwy kolumn jakie zostały do podziału, nazwę kolumny, której podziału dotyczy węzeł, prawe i lewe dziecko, wartość podziału, głębokość drzewa na danym poziomie oraz dwie listy i wartości indeksu gini dla prawego i lewego dziecka. Obie klasy wewnętrzne posiadają gettery i settery.

Klasa DecisionTree
Klasa odpowiada za tworzenie drzew. Korzysta ona ze wszystkich dotychczasowych napisanych funkcji. Drzewo składa się z głowy (head), węzłów decyzyjnych (Node.Decision) i liści (Node.Leaf). Rośnie rekurencyjnie. Do jego stworzenia potrzeba ramki danych DataFrame z ustawioną kolumną do przewidywania (setToPredict), wybranych indeksów i kolumn oraz maksymalnej głębokości drzewa.

findBestSplit(ArrayList colnames, ArrayList indexes , Gini gini)
Metoda znajduje najlepszy split (punkt splitu) ze wszystkich danych kolumn i ich indeksów, zwraca listę zawierającą nazwę kolumny i wartość, która to ma najlepszy podział zmiennych - korzysta z metody split.

split(String colname,ArrayList indexes, Gini gini)
Dla danej kolumny i indeksów znajduje najlepszy punkt podziału zmiennych - posiadający najlepszy indeks Gini. Zwraca listę zawierającą wartość splitu i index dla niego. Punkt poszukiwany jest co decyl posortowanych wartości

GrowTree(Node.Decision node)
Rekursywna metoda tworzenia drzewa.

CultureTree()
Tworzy najpierw head drzewa a potem, jeśli spełnione są odpowiednie warunki kolejne węzły drzewa, korzystając z metody GrowTree.

predict(DataFrame data)
Zwraca listę dominant - wartości przewidzianych dla każdego wiersza z podanej DataFrame.

dominant(ArrayList vals)
Oblicza dominantę dla podanych wartości.

calculatePercentages(ArrayList indexes)
Metoda nie zaimplementowana, być może w wersji 1.2. Jest odpowiedzią na podatną na nierównomierne dystrybucje dominant. W zamyśle liczy udział danej klasy w nodzie, i przechowuje to w ArrayLiście prawdopobieństw. Następnie listy są sumowane po kolumnach, a później indeks o największej wartości jest interesującą nas klasą.

Klasa RandomForest
Klasa odpowiada za tworzenie lasu z drzew decyzyjnych. Użytkownik podaje DataFrame, który jest dzielony na dwa zbiory i na ich podstawie budowany jest las oraz testowana jego jakość przewidywania.

DivisionData()
Dzieli DataFrame na zbiór testowy i treningowy, wykorzystując przy tym DivisionPergentage, który oznacza procent wierszy dla zbioru treningowego, Wyniki podziału przypisuje do pól trainData i testData.

train()
Tworzy las ze zbioru treningowego i ustawia rezultat jako pole trees.

test()
Z wykorzystaniem zbioru testowego sprawdza co przewiduje las dla danych wartości w wierszach. Zwraca listę dominant dla każdego wiersza, które sugerują przewidywaną wartość.

Powyższe metody są prywatne, aby użytkownik mógł przewidywać za pomocą lasu musi użyć metody forestResults(), która używa tych metod i zwraca wynik z metody test().

howGoodIsOurForest(ArrayList forestResults)
Umożliwia sprawdzenie jakości przewidywań lasu. Zwraca procent poprawnie przewidzianych wartości ze wszystkich jakie były (sumy).

Analiza wyników

Projekt został ukończczony zgodnie z założeniami zawartymi w konspekcie (z małymi zmianami co do kolejności wykonywania zadań i poświęconego czasu na dane punkty - zmiany jakie następiły w trakcie zostały naniesione do konspektu i można je znaleźć w pliku Kospekt(końcowa wersja).pdf). Las losowy buduje się szybko i stabilnie, jednak jego przewidywanie jest różne w zależności od zbioru. Na niektórych zbiorach dostajemy bardzo niskie skuteczności, a na niektórych zadziwiająco dobre, które mają przewidywania blisko 100% zgodne z prawidłowymi wynikami. Metoda predict oparta na przewidywaniu z wykorzystaniem dominant okazała się dobrym wyborem dla danych o równych dystrybucjach, wtedy algorytm działa tak jak byśmy chcieli.

Można założyć, że projekt został wykonany poprawnie i wynieśliśmy z niego ogromną wiedzę na temat lasów losowych. Praca grupowa przebiegała sprawnie, a jako programiści zyskaliśmy nawyk testowania każdej napisanej klasy/metody w celu znajdowania błędów i ulepszania algorytmów. Cel projektu zawarty w konspekcie został osiągnięty, jedynie możemy być niezadowoleni z jakości działania naszego algorytmu w kwestii przewidywania. Poprawianie i ulepszanie algorytmów dotyczących przewidywań, zakładają znalezienie innych metod liczenia indeksów i podziałów - czyli napisanie większości od nowa, a wcale nie oznacza to, że znaleźlibyśmy lepszy sposób. Poprawa przewidywania mogłaby zająć wiele tygodni prac nad zgłębianiem tematyki predykcji. Oznacza to, że projekt jest bardzo złożony i powstanie dobrej bilbioteki wymaga pracy wielomisięcznej, aby dopracować każdy szczegół. Biorąc to pod uwagę, jesteśmy zadowoleni z naszych rezultatów, które osiągnęliśmy w tak krótkim czasie.

About

Random Forest implementation for WUT java classes

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages