Skip to content

holalluis/CV

Repository files navigation

Lluís Mª Bosch Lladó

La última versió d'aquest document es pot trobar a https://github.com/holalluis/cv

Declaració personal

Full stack developer; programador i biotecnòleg, amb una forta inclinació cap a les matemàtiques i l'estadística. Capacitat per desenvolupar software en diversos llenguatges de programació, així com coneixements i experiència en l'automatització i tractament de grans volums de dades.

Camps d'interès

Ciències ambientals, bioinformàtica, biomedicina, enginyeria industrial i camps relacionats.

Educació / Formació

  • 2007: Batxillerat internacional (IBO), Bell-lloc del Pla (Girona).
  • 2012: Llicenciat en Biotecnologia (Universitat Autònoma de Barcelona).
  • 2013: MSc Tecnologies de la Informació i Automàtica (Universitat de Girona).

Experiència Laboral

  • Juliol 2022 - actualitat: Insitut Català de Recerca de l'Aigua. Research Support Computer Scientist. Asessorament matemàtic/informàtic a investigadors del centre a investigadors que ho requereixin. Manteniment, instal·lació de software al HPC Clúster "Undarius".

  • Juliol 2021 - Juny 2022: Universitat de Barcelona: Tècnic informàtic al projecte VIRWASTE. Tasques:

    • Manteniment plataforma Sarsaigua (operació diària, optimitzacions, correcció de bugs). Llenguatges: PHP/Javascript/SQLite3.
    • Desenvolupament plataforma "Variants": plataforma web dins de la plataforma Sarsaigua per a la visualització de resultats de la seqüenciació massiva del Sars-COV-2 per estudiar la presència de les diferents variants (Delta, Omicron, etc.) i subllinatges (Omicron BA.1, BA.2, etc). Llenguatges/Llibreries: Javascript, VUEJS, openlayers.
  • Febrer 2020 - Juliol 2021: autònom. Participació en els següents projectes:

    • Projecte SARSAIGUA (http://sarsaigua.icra.cat): xarxa de monitoratge del Sars-COV-2 en aigües residuals. Disseny i implementació de la plataforma interna: arquitectura del backend (base de dades) i disseny dels formularis de recopilació de dades per part de 56 depuradores i 3 laboratoris d'anàlisi implicats. Es van automatitzar els càlculs dels laboratoris dins els mateixos formularis perquè només s'haguessin d'introduir les dades crues de les PCR i obtenir els valors de concentració vírica. (https://covidvigilancia.icra.cat/architecture/). Únic programador. Llenguatges utilitzats: PHP, Javascript i SQLite.
    • Projecte ECAM-V3: versió 3 de la plataforma open source "ECAM". Veure descripció més avall. Transformació de l'eina ECAM V2 a Single Page App: 100% javascript client-side, sense PHP. Únic programador.
    • Projecte SUGGEREIX: Sistema d'ajuda a la decisió per a la implementació i gestió de la reutilització. Inici del projecte: disseny estructura de dades. (ACA, ICRA, Eurecat, Cetaqua, CWP, Universitat Politècnica de Catalunya).
  • Octubre 2013 - Desembre 2019: Tècnic informàtic a l'Institut Català de Recerca de l'Aigua (ICRA, Girona) amb participació en els següents projectes:

    • Projecte ECAM: plataforma web open source per comptabilitzar emissions de gasos d'efecte hivernacle per part d'infrastructures relacionades amb el cicle urbà de l'aigua (projecte WACCLIM, col·laboració amb IWA i GIZ). Únic programador. https://github.com/icra/ecam.
    • Projecte ECOADVISOR: plataforma web privada que implementa una xarxa de rius i depuradores, per simular concentracions de contaminants a punts d'interès, en funció dels paràmetres de la depuradora. Integra un model en estat estacionari de depuradora (fangs actius, nitrificació, desnitrificació, eliminació de fòsfor), un model de riu (geometria, cabal), i un mòdul per comptabilitzar energia consumida. Col·laboració amb Global Òmnium i University of Cape Town. Únic programador.
    • Projecte GESTOR: programació d'un prototip per recopilar dades de temperatura, nivell i presència d'aigua en col·lectors per detectar vessaments a temps real. Creació de plataforma per recopilar dades, i implementació d'un algoritme per detecció de canvis bruscos de temperatura.
    • Projecte europeu R3-WATER del 7è programa marc (7.2 M€): Desenvolupament d'eines informàtiques en diversos àmbits.
    • Projecte europeu EcoMaWat (PCIG-09-GA-2011-293535) (100.000€): Anàlisis estadístic de dades.
  • Juliol - Octubre 2013: Enginyer informàtic a AB-Biotics (empresa del sector biotecnològic). Creació d'una plataforma web per gestionar una base de dades interna.

  • 2012 - 2013: Investigador adjunt al Departament d'Enginyeria Electrònica i Automàtica de la Universitat de Girona. Modelització en Matlab del metabolisme de Pichia pastoris (microorganisme d'interès en la recerca i la indústria).

  • 2011: Investigador adjunt al Departament d’Enginyeria Química de la Universitat Autònoma de Barcelona, al Grup d’Enginyeria Cel·lular i Tissular (GECiT), treballant en una línia de recerca pel disseny d'una planta per la producció en massa del cianobacteri Arthrospira platensis (microorganisme d'interès en la indústria alimentària).

Idiomes

  • Català: llengua materna.
  • Castellà: nivell alt oral i escrit.
  • Anglès: nivell alt oral i escrit.
    • 2012: TOEFL iBT (ETS).
    • 2006: First Certificate Exam. (FCE, University of Cambridge).

Tecnologies de la Informació

  • Familiaritzat amb els següents sistemes operatius:
    • Linux (Debian/Ubuntu/Alpine...)
    • Apple MacOS (des de 10.5 a 10.15)
    • Microsoft Windows (des de XP a W11)
    • Free BSD.
  • Editor de text: vim.
  • git i GitHub.
  • Gestió de servidors (ssh, scp, rsync).
  • Gestió (creació, configuració i ús) de containers (Docker, Singularity)
  • Experiència en configuració de servidors Apache, Nginx.
  • Llenguatges de programació (ordenats de més a menys experiència):
    • Javascript (node, npm, vue-js)
    • HTML & CSS
    • PHP
    • Unix shell (bash, sh, zsh i similars)
    • Python
    • C/C++
    • Erlang
    • Matlab/Octave
    • Go
    • Rust
    • C#
    • R
  • Bases de dades
    • SQLite3
    • MySQL
    • PostrgresSQL
    • Redis
    • MongoDB
  • Molta experiència en entorns Linux (gestió de paquets, configuració, scripting)
  • Experiència en implementació d'algoritmes de machine learning, com ara xarxes neurals, svm, bayes, etc.
  • Experiència en SLURM, i Grid Engine (programa qsub, batch jobs) en clústers multi core (paral·lelització de processsos).
  • Interès pel software lliure (free software & open source).
  • Experiència en les plataformes de hardware lliure Arduino i Raspberry Pi.

Publicacions

  • Lluís M. Bosch, Josep Pueyo-Ros, Marc Comas-Cufí, Joan Saldaña, Jordi Ripoll, Eusebi Calle, Pau Fonseca i Casas, Joan Garcia i Subirana, Carles M. Borrego, Lluís Corominas; Watching the guards: A data-driven method to trigger warnings in national wastewater surveillance networks. J Water Health 2024; jwh2024043. doi: https://doi.org/10.2166/wh.2024.043
  • Pau Fonseca i Casas, Joan Garcia i Subirana, Lluís Corominas, Lluís Maria Bosch; Applying a Digital Twin and wastewater analysis for robust validation of COVID-19 pandemic forecasts: insights from Catalonia. J Water Health 1 March 2024; 22 (3): 584–600. doi: https://doi.org/10.2166/wh.2024.345
  • Lluís Corominas, Ian Zammit, Sergi Badia, Josep Pueyo-Ros, Lluís Maria Bosch, Eusebi Calle, David Martínez, Maria José Chesa, Cristian Chincolla, Ariadna Martínez, Anna Llopart-Mascaró, Francisco Javier Varela, Elena Domene, Marta Garcia-Sierra, Xavier Garcia-Acosta, Mar Satorras, Jordi Raich-Montiu, Roger Peris, Raül Horno, Edgar Rubión, Sergi Simón, Marc Ribalta, Ian Palacín; Profiling wastewater characteristics in intra-urban catchments using online monitoring stations. Water Sci Technol 15 March 2024; 89 (6): 1512–1525. doi: https://doi.org/10.2166/wst.2024.069
  • Guerrero-Latorre, L., Collado, N., Abasolo, N. et al. The Catalan Surveillance Network of SARS-CoV-2 in Sewage: design, implementation, and performance. Sci Rep 12, 16704 (2022). https://doi.org/10.1038/s41598-022-20957-3
  • Ribera-Guardia, Anna & Bosch, Lluis & Corominas, Lluís & Pijuan, M.. (2018). Nitrous oxide and methane emissions from a plug-flow full-scale bioreactor and assessment of its carbon footprint. Journal of Cleaner Production. 212. 10.1016/j.jclepro.2018.11.286.
  • Gimeno, Pau & Marcé, Rafael & Bosch, Lluis & Comas, Joaquim & Corominas, Lluís. (2017). Incorporating model uncertainty into the evaluation of interventions to reduce microcontaminant loads in rivers. Water Research. 124. 10.1016/j.watres.2017.07.036.
  • Montserrat, Albert & Bosch, Lluis & Kiser, Mehlika & Poch, Manel & Corominas, Lluís. (2014). Using data from monitoring combined sewer overflows to assess, improve, and maintain combined sewer systems. The Science of the total environment. 505C. 1053-1061. 10.1016/j.scitotenv.2014.10.087.

Paquets de software desenvolupats a ICRA que no són a github.com/icra

  • Implementació del protocol IEC-60870-5-102 utilitzant python (lectura de comptadors intel·ligents) per realitzar eina de monitorització i optimització energètica en base a dades històriques (producte innowatt, prototip en desenvolupament).
  • Plataforma de simulació de balanços de matèria de concentracions de productes farmacèutics en rius (col·laboració amb la investigació de les tesis doctorals de Pau Gimeno Melià, 2016 i la Dra. Laurie Boithias, 2015).
  • Eina de càlcul de quantitat de CO2 emès per indústries en base a dades de demanda elèctrica a Espanya (projecte R3-Water, 2014-2017).
  • Eina d'anàlisi de freqüències en dades de temperatura per la detecció de canvis bruscos aplicant la teoria de Fourier i Wavelets.
  • Implementació de Models de Markov per analitzar comportaments de sensors, i modelització de fallades per al control predictiu.
  • Eina de coeficients de regressió per analitzar paquets de dades multivariants.
  • Eina de detecció de valors anormals en dades multivariants aplicant l'anàlisi de components principals (PCA).
  • Desenvolupament d'una plataforma web per la modelització de tecnologies de reutilizació d'aigua en hotels (investigació del Dr. Mark Santana, ICRA, 2016).

Col·laboracions amb empreses

  • Col·laboració amb l’empresa canadenca inCTRL (www.inctrl.ca) i l’institut de recerca alemany IFAK (www.ifak.eu) pel desenvolupament de diferents mòduls dins la plataforma de simulació SIMBA#. Tasques: selecció, desenvolupament, implementació i validació d’algoritmes per quantificar i assegurar la qualitat de dades provinents de sensors.
  • Creació d'un SCADA basat en web, amb control sobre PLCs (amb sistemes de Membrane Bioreactor). Col·laboració amb el LEQUIA (Laboratori d'Enginyeria Química i Ambiental, Universitat de Girona). Únic programador.

Estades a l'estranger

  • Estada a Magdeburg (Alemanya) l'octubre de 2014 a l'institut de recerca IFAK (http://www.ifak.eu/) per rebre formació sobre el funcionament intern de la seva plataforma de simulació SIMBA#.
  • Presentació oral titulada ICRA activities in relation to s::can chemometrics, dins el workshop organitzat per l’empresa desenvolupadora de sensors S::CAN (http://www.s-can.at/) a Viena, el 14-02-2014.

Direcció de pràctiques a estudiants de grau de la UdG (supervisió i planificació de tasques) a ICRA

  • 2021: Lluís Casellas: Estimació de la petjada de carboni del cicle urbà de l'aigua de Girona: cas pràctic de l'ús de l'eina desenvolupada a ICRA "ECAM" durant el seu desenvolupament de la versió 3. El treball va servir de beta-testing i de avaluació de dades reals de forma simultània.
  • 2019: Oriol Canal: Reconciliació de la base de dades europea de sistemes de sanejament pel desenvolupament de models de contaminants aquàtics
  • 2016: Raimon Canal: Desenvolupament d’una metodologia per monitoritzar, vessaments, guardar i analitzar-ne les dades obtingudes mitjançant llenguatges de programació: PHP & MySQL. Treball de final de grau (enginyeria industrial).
  • 2015: Arnau Prats: Desenvolupament d’un prototipus basat en Arduino i web per detectar, enviar les dades de forma remota, i guardar dades històriques de vessaments en col·lectors al mateix temps que es genera energia, utilitzant material piezoelèctric. Treball de final de grau (enginyeria industrial).

Reconeixements

  • 2007: Classificat a la XX Olimpíada Nacional de Química (Córdoba), en representació de Catalunya (2n classificat).
  • 2007: Classificat a la XVIII Olimpíada Nacional de Física (Jaén), en representació de Catalunya (17è classificat).
  • 2007: 2n premi en el XX Certamen Jóvenes Investigadores (Ministeri d’Educació i Ciència) pel treball de recerca "Influència de l'ús dels antibiòtics en la resistència bacteriana".
  • 2007: Premi CIRIT per la promoció de l'esperit científic (AGAUR, Generalitat de Catalunya) pel treball de recerca.
  • 2006: Beca Botet i Sisó (Universitat de Girona) durant el batxillerat per realitzar el treball de recerca.

Annex 1: assignatures llicenciatura biotecnologia

Biologia cel·lular, bioquímica, microbiologia molecular, enginyeria de proteïnes, teràpia gènica, proteòmica, cultius cel·lulars, immunologia, virologia, fisiologia animal i vegetal, enginyeria genètica, processos de separació (downstream), biocatàlisi, control i instrumentació de processos, economia.

About

curriculum vitae

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published