Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

[#242] outputの動画のrange指定機能修正 #243

Merged
merged 2 commits into from
Dec 15, 2023

Conversation

ReiHashimoto
Copy link

Closes #242

ver1.1へマージ予定。

algorithmのoutputにImageDataを含み、かつそのデータが動画(ndim==3)の場合について、jsonではなくtiffファイルのパスをoutput_pathとして設定するように修正
これによって、VISUALIZE Plotでindex指定した際に指定の範囲でのjsonが生成されるようになる。
デフォルトの範囲は0 ~ 10で、json生成済の範囲の場合は再参照する方式なので処理が軽減される。

その他、各関数への影響確認中にsuite2p_spike_deconvでNWB保存の際のエラーが発覚したため本PR内で修正。(NWBへfunction_id単位でデータを保存する対応の際に漏れていた模様。)

@ReiHashimoto ReiHashimoto merged commit e8ed81a into develop-main Dec 15, 2023
5 checks passed
@ReiHashimoto ReiHashimoto deleted the feature/image-index branch December 15, 2023 08:16
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

Successfully merging this pull request may close these issues.

Fix loading image on VISUALIZE plot
2 participants