Vlab issue #40344

Update grid generation codes to create stand-alone regional
nests with 'halo' regions.

Fixed bug in topography filtering code for 'stretched' grids.

Updates to CHGRES to optionally output lateral boundary file,
and to remove lateral boundary halo regions from atmospheric
and surface files.

Change-Id: I4292a1ba1a1d219b92995d36c77da10a84c727cb

sorc/build_fre-nctools.sh

@@ -24,9 +24,11 @@ tmpDir=`pwd`/build
 mkdir -p $tmpDir
 cd $tmpDir
 
+set +x
 echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
 echo "//////////////////////////////////////////////////////// Environment Settings //"
 echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
+set -x
 
 #Original setup is for cray so for now require input only on a different platform.
 
@@ -49,9 +51,11 @@ fi
 
 alias make="make HDF5_HOME=${HDF5_DIR}  NETCDF_HOME=${NETCDF_DIR} NC_BLKSZ=64K SITE=${system_site} -f fre-nctools.mk"
 
+set +x
 echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
 echo "//////////////////////////////////////////////////////////// Directory Layout //"
 echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
+set -x
 
 mkdir -p share/src
 cp -r $srcDir/shared share/src/.
@@ -61,9 +65,11 @@ echo "Done..."
 
 for freNCToolsDir in tools/make_hgrid tools/make_solo_mosaic tools/fregrid
 do
+  set +x
   echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
   echo "////////////////////////////////////////////////////////////////// $freNCToolsDir:t"
   echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
+  set -x
 
   cd share/src/$freNCToolsDir
   cp fre-nctools.mk_${system_site} fre-nctools.mk
@@ -86,9 +92,11 @@ do
   cd $tmpDir
 done
 
+set +x
 echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
 echo "///////////////////////////////////////////////////////////////// filter_topo //"
 echo "////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
+set -x
 
 cd ../tools/filter_topo
 ./make.csh_${target}
@@ -97,4 +105,13 @@ mv filter_topo $home_dir/exec/.
 echo "\n////////// CLEANING UP TEMPORARY BUILD AREA //////////\n"
 rm -fr $tmpDir
 
+set +x
+echo "///////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
+echo "///////////////////////////////////////////////////////////////// shave  //"
+echo "///////////////////////////////////////////////////////////////////////////"
+set -x
+
+cd $srcDir/tools/shave.fd
+./build_shave $system_site
+
 exit