Convert archive jobs to proper j-jobs

jobs/JENKFGDAS_ARCHIVE

@@ -0,0 +1,91 @@
+#! /usr/bin/env bash
+
+source "$HOMEgfs/ush/preamble.sh"
+
+#############################
+# Source relevant config files
+#############################
+export EXPDIR=${EXPDIR:-${HOMEgfs}/parm/config}
+configs="base earc"
+config_path=${EXPDIR:-${NWROOT}/gfs.${gfs_ver}/parm/config}
+for config in ${configs}; do
+    . ${config_path}/config.${config}
+    status=$?
+    [[ ${status} -ne 0 ]] && exit ${status}
+done
+
+##########################################
+# Source machine runtime environment
+##########################################
+. ${HOMEgfs}/env/${machine}.env earc
+status=$?
+[[ ${status} -ne 0 ]] && exit $status
+
+##############################################
+# Obtain unique process id (pid) and make temp directory
+##############################################
+export pid=${pid:-$$}
+export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid:?}}
+mkdir -p $DATA
+cd $DATA
+
+
+##############################################
+# Run setpdy and initialize PDY variables
+##############################################
+export cycle="t${cyc}z"
+setpdy.sh
+. ./PDY
+
+
+##############################################
+# Determine Job Output Name on System
+##############################################
+export pgmout="OUTPUT.${pid}"
+export pgmerr=errfile
+
+
+##############################################
+# Set variables used in the script
+##############################################
+export CDATE=${CDATE:-${PDY}${cyc}}
+export CDUMP=${CDUMP:-${RUN:-"gfs"}}
+export COMPONENT=${COMPONENT:-atmos}
+export n=$((ENSGRP))
+
+##############################################
+# Begin JOB SPECIFIC work
+##############################################
+
+# ICS are restarts and always lag INC by $assim_freq hours.
+export EARCINC_CYC=${ARCH_CYC}
+export EARCICS_CYC=$((ARCH_CYC-assim_freq))
+if [ ${EARCICS_CYC} -lt 0 ]; then
+  export EARCICS_CYC=$((EARCICS_CYC+24))
+fi
+
+# EnKF update in GFS, GDAS or both
+export CDUMP_ENKF=$(echo ${EUPD_CYC:-"gdas"} | tr a-z A-Z)
+
+export ARCH_LIST="${ROTDIR}/enkf${CDUMP}.${PDY}/${cyc}/${COMPONENT}/earc${ENSGRP}"
+
+###############################################################
+# Run archive script
+###############################################################
+
+$SCRgfs/exgdas_enkf_earc.sh
+status=$?
+[[ $status -ne 0 ]] && exit $status
+
+###############################################################
+
+echo "ENDED NORMALLY."
+
+##########################################
+# Remove the Temporary working directory
+##########################################
+cd $DATAROOT
+[[ ${KEEPDATA} = "NO" ]] && rm -rf $DATA
+
+date
+exit 0

jobs/JGLOBAL_ARCHIVE

@@ -0,0 +1,105 @@
+#! /usr/bin/env bash
+
+source "$HOMEgfs/ush/preamble.sh"
+
+export RUN_ENVIR=${RUN_ENVIR:-"nco"}
+
+#############################################
+# Source relevant config files
+#############################################
+export EXPDIR=${EXPDIR:-$HOMEgfs/parm/config}
+configs="base arch"
+config_path=${EXPDIR:-$NWROOT/gfs.${gfs_ver}/parm/config}
+for config in $configs; do
+    . $config_path/config.$config
+    status=$?
+    [[ $status -ne 0 ]] && exit $status
+done
+
+##########################################
+# Source machine runtime environment
+##########################################
+. $HOMEgfs/env/${machine}.env arch
+status=$?
+[[ $status -ne 0 ]] && exit $status
+
+#############################################
+# Source workflow level common utilities
+#############################################
+#### This utility is under development as of 20221020
+####   will not use it at this time
+#### source "${HOMEgfs}/ush/file_utils.sh"
+
+##############################################
+# Obtain unique process id (pid) and make temp directory
+##############################################
+export pid=${pid:-$$}
+export DATA=${DATA:-${DATAROOT}/${jobid:?}}
+mkdir -p $DATA
+cd $DATA
+
+
+##############################################
+# Run setpdy and initialize PDY variables
+##############################################
+export cycle="t${cyc}z"
+setpdy.sh
+. ./PDY
+
+
+##############################################
+# Determine Job Output Name on System
+##############################################
+export pgmout="OUTPUT.${pid}"
+export pgmerr=errfile
+
+
+##############################################
+# Set variables used in the script
+##############################################
+export CDATE=${CDATE:-${PDY}${cyc}}
+export CDUMP=${CDUMP:-${RUN:-"gfs"}}
+export COMPONENT=${COMPONENT:-atmos}
+
+
+##############################################
+# Begin JOB SPECIFIC work
+##############################################
+
+# ICS are restarts and always lag INC by $assim_freq hours
+export ARCHINC_CYC=$ARCH_CYC
+export ARCHICS_CYC=$((ARCH_CYC-assim_freq))
+if [ $ARCHICS_CYC -lt 0 ]; then
+    ARCHICS_CYC=$((ARCHICS_CYC+24))
+fi
+
+# CURRENT CYCLE
+export APREFIX="${CDUMP}.t${cyc}z."
+export ASUFFIX=${ASUFFIX:-$SUFFIX}
+
+if [ $ASUFFIX = ".nc" ]; then
+   format="netcdf"
+else
+   format="nemsio"
+fi
+
+###############################################################
+# Run archive script
+###############################################################
+
+${GLOBALARCHIVESH:-$SCRgfs/exglobal_archive.sh}
+status=$?
+[[ $status -ne 0 ]] && exit $status
+
+###############################################################
+
+echo "ENDED NORMALLY."
+
+##########################################
+# Remove the Temporary working directory
+##########################################
+cd $DATAROOT
+[[ $KEEPDATA = "NO" ]] && rm -rf $DATA
+
+date
+exit 0